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自治区教育厅主要职责是：
（一）全面贯彻执行党和国家有关教育工作的方针政策和法规，拟定自治区教育改革与发展的方针、政策和规划，起草有关法规规章和管理办法，并监督实施。
（二）负责各级各类教育的统筹规划和综合协调，制定全区教育事业发展规划和计划，确定教育事业发展重点、规模、速度和步骤，指导教育教学改革，统计、分析和发布教育基本信息。
（三）综合管理全区幼儿教育、基础教育、高等教育、职业教育、成人教育、社会力量办学等，指导教育体制和办学体制改革工作。
（四）组织、指导、协调全区各级各类学校（含学前教育机构）“双语”教学工作。
（五）负责义务教育的宏观指导与协调，推进义务教育均衡发展，促进教育公平，指导普通高中教育、幼儿教育和特殊教育工作。
（六）统筹指导以就业为导向的职业教育的发展和改革。
（七）统筹指导各类高等教育和继续教育的发展与改革，落实和扩大高校办学自主权。
（八）承担自治区人民政府教育督导团的具体工作，制定自治区教育督导计划和评估方案，并进行指导、监督、检查、评估。
（九）参与拟定教育经费筹措、管理和学生资助的方针、政策，负责统计全区教育经费投入情况；指导、协调全区各级各类学校家庭经济困难学生的资助管理工作。
（十）指导各级各类学校的德育工作、体育卫生艺术教育工作，协助有关部门做好学校国防教育和军训工作。
（十一）指导教育系统人才队伍建设，负责各级各类教师资格认定和继续教育等工作。
（十二）指导、协调各类教材和教辅用书的编译、审定和出版工作；配合有关部门做好学校语言文字工作。
（十三）归口管理全区学历教育及其考试工作，会同有关部门制定自治区属高等学校招生计划，并组织实施。
（十四）参与拟定普通高等学校毕业生就业政策，指导普通高等学校开展大学生就业创业工作。
（十五）规划、指导教育系统自然科学和哲学社会科学研究，以及科技成果转化、教育信息化和产学研结合等工作。
（十六）协调内地与新疆、区内教育对口支援工作。
（十七）归口管理与国外和港澳台的教育合作与交流，指导、协调汉语国际推广工作。
（十八）实施国家学位制度，负责全区学位授予工作。
（十九）指导教育系统各类学会、协会、研究会、基金会等社团组织工作。
（二十）承办自治区人民政府交办的其它工作。
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